МР-41 является вариантом МР-40 с деревянным прикладом, автором этой идеи был Хуго Шмайссер, он установил ствол и затворную коробку пистолета-пулемёта MP-40 в деревянную ложу.
Также в МР-41 присутствовал переводчик режимов огня, за счёт чего теперь было проще вести одиночный огонь. На новом пистолете-пулемёте был увеличен до нормального темп стрельбы. Благодаря деревянному прикладу теперь была возможность стрелять более точно, но существенных достоинств МР-41 по сравнению с уже ставшим массовым и известным пистолетом-пулемётом МР-40 не было. Это послужило причиной тому, что МР-41 производился в малых количествах.